L'application de la loi LRU a été pensée de manière à tenir compte des positions des organisations syndicales, et des réalités de l'enseignement supérieur. C'est pourquoi, dans le but de mener à bien la réforme des universités conformément à la logique d'intérêt général qui anime tous ses acteurs, a été créé le Comité de suivi de la LRU ayant pour objectif d'observer le déroulement, les obstacles et les effets de l'application de la loi. Ce comité a rendu son 4ème rapport le 30 janvier 2012. Le rapport 20 Il met sur la table plusieurs axes de travail sur lesquels le Ministre souhaite avancer, parmi lesquels:

- la place des personnalités extérieures dans le conseil d'administration des universités,

- la généralisation du Sénat académique, -la déontologie, qui fait l'objet d'une mission confiée à une personnalité scientifique reconnue, le professeur Claudine Tiercelin,

- la modulation des tâches des enseignants-chercheurs, de façon à accorder plus de temps aux chercheurs pour leurs activités scientifiques,

-l'insertion professionnelle des étudiants.

Dans son bilan sur l'exécution de la loi L.R.O., le Comité aborde cette année deux domaines nouveaux: l'opération Campus et la dévolution du patrimoine. Il appelle à poursuivre le travail pour lever les freins à l'autonomie et propose des solutions concrètes à des questions clés comme celles de l'allocation des moyens, de la contractualisation entre l'État et les établissements, de l'évolution du rôle de l'État vers une mission de stratège et de régulation des grands enjeux nationaux.