Les effectifs des élèves sont connus de manière fiable depuis 2002/2003, année de la mise en place du système d'information MAGE à l'Agence pour l'enseignement français à l'étranger. Entre l'année 2002/2003 et l'année 2014/2015, le nombre d'élèves français en Indonésie bénéficiaires d'une bourse scolaire AEFE est passé de 46 (pour un montant de 94 425 euros) à 117 (pour un montant de 638 256 euros). Il était de 64 en 2003/2004, 75 en 2004/2005, 81 en 2005/2006 et 2006/2007, 78 en 2007/2008, 91 en 2008/2009, 112 en 2009/2010, 122 en 2010/2011, 130 en 2011/2012, 129 en 2012/2013 et 114 en 2013/2014. Cette évolution est à mettre en regard du nombre d'enfants français scolarisés - passé de 417 à 727 sur la même période - dans les trois établissements d'Indonésie homologués (Lycée international français de Jakarta, Ecole internationale française de Bali et Ecole de Balikpapan). Le pourcentage d'élèves français ayant disposé d'une bourse en Indonésie est passé de 11 % en 2002/2003 à 16 % en 2014/2015, avec l'évolution suivante : 18,9 % en 2003/2004, 15,9 % en 2004/2005, 16,2 % en 2005/2006, 21,3 % en 2006/2007, 16,9 % en 2007/2008, 18 % en 2008/2009, 21,4 % en 2009/2010, 20,9 % en 2010/2011 et 2011/2012, 19,7 % en 2012/2013 et 16,4 % en 2013/2014. Le pourcentage d'élèves français boursiers en Indonésie se situe en deça du pourcentage enregistré en moyenne mondiale (21 %).