Les responsabilités confiées aux différentes chaînes de commandement s'appuient sur des ordres et des directives adossés aux préconisations du ministère des solidarités et de la santé pour lutter contre la propagation du Covid-19. Leur formalisation et leur cadre réglementaire ont été jugés conformes, exhaustifs et clairs. Ils ont évolué à mesure que progressait la connaissance du virus. L'étude de l'ensemble de ces documents a démontré une forte convergence et une grande précision dans l'esprit et dans la lettre, non seulement vers le groupe aéronaval (GAN) mais également vers l'ensemble des forces engagées en opérations à travers le monde. En effet, l'exhaustivité des préconisations, leur évolutivité et leur mise à jour n'ont pas souffert de discontinuités ou de défauts, même s'il apparaît clairement que la gestion de la crise a été compliquée par la méconnaissance de ce virus. Les enquêtes ont identifié des facteurs de dysfonctionnements, dont le manque de connaissance du virus fin mars-début avril, une perception de terrain altérée par les succès de la lutte contre le H1-N1 quelques années plus tôt et les spécificités d'aménagement du Charles-de-Gaulle du fait de sa conception ancienne.